Gegevens uit de recente 2016 Census laten zien dat ongeveer 76% van Puerto Ricanen afkomstig is uit de blanke etnische groep, wat zich vertaalt naar meer dan 2.82 miljoen mensen. Puerto Ricanen van Afrikaanse afkomst vormen de op één na grootste etnische groep in Puerto Rico, goed voor 12.4% van de totale bevolking. Mixed race is de op drie na grootste groep, waarbij meer dan 122,000-mensen zichzelf identificeren als ten minste twee races. De Mixed Race-groep wordt gevolgd door de Indiaanse en Aziatische etnische groepen, die respectievelijk 0.5% en 0.2% van alle Puerto Ricanen vertegenwoordigen. Inheemse Hawaiianen zijn het kleinste etnische segment in Puerto Rico, omdat ze in totaal maar 370 zijn, wat overeenkomt met 0.1% van de totale bevolking. Over 290,000 Puerto Ricanen identificeren zichzelf als zijnde van "andere rassen", equivalent aan ongeveer 8% van de totale bevolking.
Oorspronkelijke etnische groep: Taino
De oorspronkelijke bewoners van Puerto Rico stonden bekend als Taino-indianen die eeuwenlang de eilanden bewonen. De etnische groep was de enige etnische groep in Puerto Rico voor honderden jaren, tot de komst van Europeanen in de 16 eeuw. Een telling uitgevoerd in 1765 toonde aan dat 49.6% van de inwoners van Puerto Rico van "andere rassen" was, wat de dominante etnische groep van die tijd was. De komst van de vroege Spaanse kolonisten betekende het verval van de Taino, omdat ze ziekten meebrachten waartegen Tainos geen verdediging had, zoals influenza, waterpokken en mazelen. Deze ziekten hebben de Tainos in Puerto Rico vrijwel weggevaagd, waardoor de witte Spanjaarden de nieuwe dominante etnische groep van Puerto Rico zijn geworden.
Afrikaanse slaven
De zwarte etnische groep of Puerto Ricanen van Afrikaanse afkomst zijn ontstaan uit slaven of bevrijde slaven. Sinds de bezetting van Puerto Rico heeft Spanje Afrikaanse slaven naar werk gebracht op boerderijen op de eilanden. In de 16e eeuw trokken Afrikaanse slaven duizenden eilanden in. Een 1791-slavenopstand in het naburige Saint Domingue (het hedendaagse Haïti) zorgde ervoor dat veel Fransen zich vestigden in Puerto Rico, omdat ze ontsnapten aan de onrust die daarop volgde.